Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP2LQ8IYA6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms