Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms