Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF13Q86YI8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms