Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALYREFQ86V81 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALYREFQ86V81 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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