Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC84Q86UT8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms