Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC149Q6ZUS6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms