Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CFAP47Q6ZTR5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CFAP47Q6ZTR5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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