Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf50Q6ZRC1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf50Q6ZRC1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms