Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO4Q6UY18 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms