Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms