Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL17Q6UXB2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL17Q6UXB2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms