Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A10Q6U841 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms