Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPH2Q6IBW4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPH2Q6IBW4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPH2Q6IBW4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPH2Q6IBW4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPH2Q6IBW4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCAPH2Q6IBW4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAPH2Q6IBW4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms