Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.34
CHIC1Q5VXU3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CHIC1Q5VXU3 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CHIC1Q5VXU3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms