Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOCADQ5VW36 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOCADQ5VW36 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms