Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GARNL3Q5VVW2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms