Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBAP2Q5T6F2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms