Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms