Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM1Q2NKQ1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM1Q2NKQ1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms