Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RFX7Q2KHR2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms