Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
FOXD1Q16676 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
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