Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAPC1Q16533 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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