Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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