Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USF2Q15853 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USF2Q15853 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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