Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NECTIN1Q15223 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
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