Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KARSQ15046 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KARSQ15046 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KARSQ15046 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KARSQ15046 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KARSQ15046 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KARSQ15046 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KARSQ15046 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KARSQ15046 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KARSQ15046 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KARSQ15046 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KARSQ15046 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KARSQ15046 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KARSQ15046 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KARSQ15046 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KARSQ15046 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KARSQ15046 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KARSQ15046 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KARSQ15046 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KARSQ15046 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KARSQ15046 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KARSQ15046 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KARSQ15046 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KARSQ15046 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KARSQ15046 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KARSQ15046 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KARSQ15046 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KARSQ15046 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KARSQ15046 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KARSQ15046 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KARSQ15046 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KARSQ15046 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KARSQ15046 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KARSQ15046 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KARSQ15046 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KARSQ15046 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KARSQ15046 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KARSQ15046 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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