Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPHQ15003 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
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