Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL4Q14135 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VGLL4Q14135 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms