Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR3Q13615 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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