Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.785e-7■■□□□ 12.6
TRA2AQ13595 NFAT5-207ENST00000565301 653 ntTSL 23.5□□□□□ -1.855e-7■■□□□ 12.6
TRA2AQ13595 DDIT3-203ENST00000547526 644 ntTSL 311.99□□□□□ -0.495e-7■■□□□ 12.5
TRA2AQ13595 FOXJ3-207ENST00000445886 1326 ntTSL 1 (best)22.75■■□□□ 1.236e-7■■□□□ 12.5
TRA2AQ13595 EPRS-204ENST00000477030 1526 ntTSL 1 (best)20.25■□□□□ 0.836e-7■■□□□ 12.5
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TRA2AQ13595 CDC73-202ENST00000477868 764 ntTSL 36.34□□□□□ -1.396e-7■■□□□ 12.5
TRA2AQ13595 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.446e-7■■□□□ 12.5
TRA2AQ13595 FOXJ3-208ENST00000454417 499 ntTSL 33.27□□□□□ -1.896e-7■■□□□ 12.5
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TRA2AQ13595 SON-220ENST00000492229 306 ntTSL 52.17□□□□□ -2.064e-8■■□□□ 12.5
TRA2AQ13595 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.336e-8■■□□□ 12.5
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TRA2AQ13595 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.63e-12■■□□□ 12.4
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TRA2AQ13595 NASP-223ENST00000534450 632 ntTSL 26.92□□□□□ -1.34e-8■■□□□ 12.4
TRA2AQ13595 LUC7L3-213ENST00000508218 533 ntTSL 211.79□□□□□ -0.522e-8■■□□□ 12.4
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TRA2AQ13595 APLP2-218ENST00000533532 584 ntTSL 220.75■□□□□ 0.912e-8■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 APLP2-221ENST00000533713 560 ntTSL 420.75■□□□□ 0.912e-8■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 APLP2-217ENST00000533195 560 ntTSL 420.75■□□□□ 0.912e-8■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 APLP2-214ENST00000530132 542 ntTSL 420.75■□□□□ 0.912e-8■■□□□ 12.3
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TRA2AQ13595 ACIN1-208ENST00000553721 610 ntTSL 38.19□□□□□ -1.12e-8■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 APLP2-212ENST00000529483 323 ntTSL 55.85□□□□□ -1.472e-8■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 APLP2-206ENST00000525215 478 ntTSL 24.06□□□□□ -1.762e-8■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 APLP2-205ENST00000461918 553 ntTSL 33.81□□□□□ -1.82e-8■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 CWC25-205ENST00000619462 650 ntTSL 58.07□□□□□ -1.122e-6■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 CCNL2-206ENST00000463260 1941 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.123e-14■■□□□ 12.3
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