Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCIRG1Q13488 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
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