Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO2Q13137 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
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