Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF1Q13077 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF1Q13077 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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