Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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