Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 MIG2YGL209W 1149 nt3.43□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 SUI2YJR007W 915 nt3.43□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 MRPL38YKL170W 417 nt3.43□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 MPD2YOL088C 834 nt3.43□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 SWD3YBR175W 948 nt3.43□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 AIM4YBR194W 372 nt3.43□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 PDC2YDR081C 2778 nt3.43□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 DNM1YLL001W 2274 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 MED1YPR070W 1701 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 HLR1YDR528W 1272 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YFL015CYFL015C 495 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YGL082WYGL082W 1146 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 BTS1YPL069C 1008 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YCL019WYCL019W 5313 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 ATP22YDR350C 2055 nt3.42□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 MSH4YFL003C 2637 nt3.41□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YAT2YER024W 2772 nt3.41□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 NAB6YML117W 3405 nt3.41□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YGL176CYGL176C 1665 nt3.41□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 DOG2YHR043C 741 nt3.41□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 DSE2YHR143W 978 nt3.41□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YIL141WYIL141W 390 nt3.41□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.41□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YNL043CYNL043C 321 nt3.41□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 HAT1YPL001W 1125 nt3.41□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 NET1YJL076W 3570 nt3.41□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 FLO5YHR211W 3228 nt3.41□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 STN1YDR082W 1485 nt3.41□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 PPH3YDR075W 927 nt3.4□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YGL159WYGL159W 1113 nt3.4□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 GOS1YHL031C 672 nt3.4□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 THP2YHR167W 786 nt3.4□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.4□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 CTK2YJL006C 972 nt3.4□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 DLS1YJL065C 504 nt3.4□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YOL106WYOL106W 354 nt3.4□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 RPB8YOR224C 441 nt3.4□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 KAR4YCL055W 1008 nt3.4□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 STU2YLR045C 2667 nt3.39□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YKL100CYKL100C 1764 nt3.39□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 KHA1YJL094C 2622 nt3.39□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 HMO1YDR174W 741 nt3.39□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YJL032WYJL032W 315 nt3.39□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YAL066WYAL066W 309 nt3.39□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 MER1YNL210W 813 nt3.39□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YCK2YNL154C 1641 nt3.39□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YMR317WYMR317W 3423 nt3.39□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 SOK1YDR006C 2706 nt3.39□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 ESA1YOR244W 1338 nt3.39□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 SSE2YBR169C 2082 nt3.39□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 STT4YLR305C 5703 nt3.38□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 CPR5YDR304C 678 nt3.38□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YFR057WYFR057W 456 nt3.38□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 VMA7YGR020C 357 nt3.38□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 DAD2YKR083C 402 nt3.38□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 SPC2YML055W 537 nt3.38□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YNL013CYNL013C 378 nt3.38□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 SFG1YOR315W 1041 nt3.38□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 RPC40YPR110C 1008 nt3.38□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 RFC5YBR087W 1065 nt3.38□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.38□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 HSE1YHL002W 1359 nt3.38□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 AVT2YEL064C 1443 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 AI2Q0055 2565 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 HTB1YDR224C 396 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 RMT2YDR465C 1239 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 EMI1YDR512C 564 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 VEL1YGL258W 621 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YGR160WYGR160W 612 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 SRL3YKR091W 741 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 RPS30AYLR287C-A 192 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 VMA6YLR447C 1038 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 ADI1YMR009W 540 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 RIM9YMR063W 720 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YOR097CYOR097C 528 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YOR331CYOR331C 558 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 SLM4YBR077C 489 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 VHR2YER064C 1518 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 RGC1YPR115W 3252 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 HOP1YIL072W 1818 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YTA7YGR270W 4140 nt3.37□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YCR099CYCR099C 468 nt3.36□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 ATC1YDR184C 885 nt3.36□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YGL039WYGL039W 1047 nt3.36□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 COX6YHR051W 447 nt3.36□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 GPX1YKL026C 504 nt3.36□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 ARC18YLR370C 537 nt3.36□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 PRE8YML092C 753 nt3.36□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YME2YMR302C 2553 nt3.36□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YSP2YDR326C 4317 nt3.35□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 PUF6YDR496C 1971 nt3.35□□□□□ -1.87
RTP1Q12751 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.9 ms