Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPSF1Q10570 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
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