Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CGNL1Q0VF96 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNL1Q0VF96 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms