Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 PEX18YHR160C 852 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 MMF1YIL051C 438 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 LSM8YJR022W 330 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 DAD2YKR083C 402 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YAR069CYAR069C 294 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 SUB1YMR039C 879 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YNL234WYNL234W 1281 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 ATG34YOL083W 1239 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YOL114CYOL114C 609 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YPR027CYPR027C 834 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 LTP1YPR073C 486 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 DPB3YBR278W 606 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 MAK5YBR142W 2322 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 VHR2YER064C 1518 nt2.26□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 AVT5YBL089W 1380 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 RPL24BYGR148C 468 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 SED5YLR026C 1023 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 VMA6YLR447C 1038 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 ECM13YBL043W 774 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 INP1YMR204C 1263 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 RPL20AYMR242C 519 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YNL043CYNL043C 321 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 TPT1YOL102C 693 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 RPB8YOR224C 441 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 SRL1YOR247W 633 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 SGS1YMR190C 4344 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 SLN1YIL147C 3663 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 PSY2YNL201C 2577 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 SRO77YBL106C 3033 nt2.25□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 ERP3YDL018C 678 nt2.24□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YDR336WYDR336W 945 nt2.24□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 UPF3YGR072W 1164 nt2.24□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 PFS1YHR185C 714 nt2.24□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 RPA12YJR063W 378 nt2.24□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 RIF2YLR453C 1188 nt2.24□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YOR387CYOR387C 621 nt2.24□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 RRD2YPL152W 1077 nt2.24□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.24□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 ATP22YDR350C 2055 nt2.24□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 NEW1YPL226W 3591 nt2.24□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YPP1YGR198W 2454 nt2.24□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 MET6YER091C 2304 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YDR131CYDR131C 1671 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 SNU23YDL098C 585 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 AI3Q0060 1248 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 HMO1YDR174W 741 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 FMN1YDR236C 657 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 SPT15YER148W 723 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 TCD1YHR003C 1290 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 CPR7YJR032W 1182 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 HOT13YKL084W 351 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 EMC6YLL014W 327 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 MPD2YOL088C 834 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YOR050CYOR050C 348 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YPR203WYPR203W 309 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 RGR1YLR071C 3249 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 MSH4YFL003C 2637 nt2.23□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 POL4YCR014C 1749 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 snR68snR68 136 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YGL159WYGL159W 1113 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 TDA10YGR205W 873 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 MET14YKL001C 609 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YLL047WYLL047W 384 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 MIC27YNL100W 705 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 THI80YOR143C 960 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 GRX7YBR014C 612 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 ERV15YBR210W 429 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 snR43snR43 209 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YBR259WYBR259W 2067 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 CBP2YHL038C 1893 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 SLY41YOR307C 1362 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 AI4Q0065 1671 nt2.22□□□□□ -2.05
NIP7Q08962 YNL011CYNL011C 1335 nt2.21□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 YNR066CYNR066C 1311 nt2.21□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 TAF2YCR042C 4224 nt2.21□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 JSN1YJR091C 3276 nt2.21□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 YIL054WYIL054W 318 nt2.21□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 FLO11YIR019C 4104 nt2.21□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.21□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 REC102YLR329W 795 nt2.21□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 GAB1YLR459W 1185 nt2.21□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 ARP9YMR033W 1404 nt2.21□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 TSR4YOL022C 1227 nt2.21□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 STN1YDR082W 1485 nt2.2□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 PEX5YDR244W 1839 nt2.2□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 FIN1YDR130C 876 nt2.2□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 ATP11YNL315C 957 nt2.2□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 YOL118CYOL118C 309 nt2.2□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 SKT5YBL061C 2091 nt2.2□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 ADY4YLR227C 1482 nt2.2□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 ARP8YOR141C 2646 nt2.2□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 SAP1YER047C 2694 nt2.19□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 KIN82YCR091W 2163 nt2.19□□□□□ -2.06
NIP7Q08962 AVT2YEL064C 1443 nt2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43 ms