Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNDQ07001 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms