Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTDSPL2Q05D32 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms