Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms