Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms