Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL6Q02878 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms