Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms