Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VLDLRP98155 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VLDLRP98155 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms