Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms