Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HERVK_113P63132 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms