Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL11P62913 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL11P62913 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL11P62913 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL11P62913 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms