Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK4P57078 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIPK4P57078 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIPK4P57078 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RIPK4P57078 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RIPK4P57078 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RIPK4P57078 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RIPK4P57078 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RIPK4P57078 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RIPK4P57078 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RIPK4P57078 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RIPK4P57078 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIPK4P57078 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RIPK4P57078 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK4P57078 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK4P57078 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK4P57078 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK4P57078 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK4P57078 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK4P57078 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK4P57078 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK4P57078 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK4P57078 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK4P57078 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK4P57078 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK4P57078 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK4P57078 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK4P57078 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK4P57078 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK4P57078 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK4P57078 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK4P57078 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK4P57078 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK4P57078 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK4P57078 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIPK4P57078 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.51■■■□□ 2
RIPK4P57078 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RIPK4P57078 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms