Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRG3P56975 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRG3P56975 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRG3P56975 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG3P56975 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG3P56975 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG3P56975 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG3P56975 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG3P56975 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG3P56975 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG3P56975 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG3P56975 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRG3P56975 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NRG3P56975 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NRG3P56975 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NRG3P56975 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRG3P56975 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRG3P56975 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG3P56975 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG3P56975 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG3P56975 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG3P56975 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG3P56975 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG3P56975 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG3P56975 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG3P56975 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG3P56975 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG3P56975 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG3P56975 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG3P56975 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG3P56975 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms